Arbetsgrupper i MSR är organ där styrelseledamöter finns representerade vid och består av följande:

PK (Programkommittén)

Programkommittén är det styrande organet för läkarprogrammet i Uppsala. Där sitter ett antal ledamöter. Ordförande är Bertil Lindahl, professor i kardiologi. MSR har tre ledamöter i programkommittén för läkarprogrammet.

Programrådet

Kursledare från alla terminer samlas. MSR bevakar detta mötet med 2 representanter.

GRUNK (Grundutbildningskommittén)

Kommittén vid medicinska fakulteten för utbildning på grundnivå och avancerad nivå, är det styrande organet för alla programmen i medicinska fakulteten vid Uppsala Universitet, det vill säga: läkarprogrammet, sjuksköterskeprogrammet, fysioterapeutprogrammet, logopedprogrammet, biomedicinprogrammet, biomedicinskanalytiker-programmet samt alla masterprogram. Här sitter ordförande från varje programkomitté tillsammans med studentrepresentanter. Ordförande för GRUNK för Mats Målqvist, professor i global hälsa vid institutionen för kvinnors och barns hälsa.

IK (Internationella kommitten)

Internationella kommitten är en arbetsgrupp som jobbar med alla internationaliseringsfrågor på programmet, t ex utbyten för studenter.

ULO (Gruppen för Undervisningslokaler)

ULO består av lokalansvariga på Akademiska sjukhus, lärare/handledare från medicinska fakulteten och studenter. Här ser MSR till att bl.a. lunchrum, kandidatsalar och omklädningsrum för studenter planeras in när sjukhuset bygger ut.

KUA (Klinisk Undervisningsavdelning)

KUA är ansvarsgruppen för den Kliniska Undervisnings Avdelningen som är en kurs på termin 10. Även här sitter MSR med för att bidra med studentperspektiv.

MF (Medicinska Föreningen)

Medicinska föreningen består av en styrelse som väljs av studenter på läkarprogrammet samt en studentrepresentant för varje underförening.

MedSek (medicinska sektionen)

I medicinska sektionen sitter representanter från alla studieråd från den medicinska fakulteten och detta är studierådets kontakt med Uppsalas studentkår

PU (Professionell Utveckling)

OMSIS (Ordförandekonventet för Medicinstuderande i Sverige)

Nationell grupp där representanter från samtliga läkarprogram i Sverige samlas två gånger per termin.

EPA (Entrustable Professional Activities)

EPA avser olika kliniska färdigheter som ingår i en läkares dagliga arbete som man förväntas kunna utföra självständigt efter avslutad grundutbildning. Systemet är utformat så man kan följa studentens utveckling under programmets gång. I Uppsala har det startats upp piloter på ett flertal kurser, bland annat infektion, PU och hjärta. En representant från MSR deltar vid dessa möten 1 gång i månaden för att följa arbetet och bidra med studentperspektiv.